本科室提供的治疗为横隔膜以上，除心脏和血管以外的全部胸部脏器手术及儿科外科手术，包括呼吸系统手术、纵隔手术、乳腺和甲状腺手术。本科室由资深专家及相关医学会认定的指导医生组成。我们的使命是充分发挥最先进的医疗技术，为重症患者提供安全有效的外科手术治疗。目前我们的团队每年进行的胸腔手术量超过650例，治疗成绩在日本名列前茅。本科室的重点治疗领域是胸外科，在纵隔疾病、原发性和转移性肺癌、肺良性肿瘤、气胸等领域，凭借丰富的经验，实施最安全的治疗。

近年来，包括机器人手术在内的胸腔镜手术被广泛运用，手术的类型也由开胸转向微创。福冈大学医院是日本最早使用该项新技术的机构之一，众多福冈本地及日本各地患者纷纷来本院接受治疗。本院的内窥镜手术教育课程吸引了众多医生来本院学习该项新技术。

肺移植手术适用于治疗年纪较轻的重度呼吸衰竭患者。目前在日本只有九个正式获得批准的脑死亡肺移植机构，本院就是其中之一。本科室在九州进行了首次脑死亡肺移植，并成功地为世界上最年轻的病人移植了活体肺。本院还是日本为数不多的可以进行肺减容手术的设施之一，患者大多为老年人。在严格的标准下，我院已为近100名的老年患者进行了肺气肿的肺减容术。

福冈大学医院还提供全方位的乳腺癌治疗。除了常规的外科手术外，结合整形外科的乳房再造手术、放射科的放射治疗、肿瘤科的化疗等多种手段，多科室横向联合，以取得最佳的治疗效果。

福冈大学医院被指定为福冈市综合围产母子医疗中心。目前新生儿外科手术正日趋增多，最先进的内窥镜手术也可以被运用在儿科手术中。小儿外科团队每年对新生儿至青少年患者提供约150 次手术治疗服务。 我们不仅治疗腹股沟疝、隐睾、肠套叠、阑尾炎等常见疾病，还治疗需要在新生儿期进行手术的食管闭锁、肠闭锁和肛门闭锁等先天性疾病。由于涉及的疾病种类较多，我们采取积极与其他科室携手的方式进行联合治疗。 我们尤其重视内窥镜手术治疗，旨在为儿童患者减轻身体负担。